Какие Правила плавания на маломерных судах действуют в РФ?

Абсолютно все! Никаких исключений для маломерных судов, не подлежащих гос.регистрации, - нет!
Это однозначно вытекает из норм - Кодекса внутреннего водного транспорта и Кодекса торгового мореплавания РФ и иных нормативных актов.
В частности, пунктом 16 Правил пользования маломерными судами установлено, что судоводитель или лицо, управляющее маломерным судном, обязаны выполнять требования:

• Правил пользования маломерными судами
• ППВВП
• МППСС-72
• Обязательных постановлений в морском порту
• Правил пропуска судов через шлюзы внутренних водных путей
• правил пользования водными объектами для плавания на маломерных судах, утверждаемых в соответствии с пунктом 7 статьи 25 Водного кодекса Российской Федерации
• иных правил, обеспечивающих безаварийное плавание судов, безопасность людей на воде и охрану окружающей природной среды

По общему правилу маломерным судам запрещен выход на судовой ход.
Законно выходить на судовой ход все же можно в некоторых случаях:

1. Для пересечения судового хода. В этом случае необходимо строго руководствоваться требованиями правил плавания (пункт 94 Приказа Минтранса РФ от 19 января 2018 г. N 19 "Об утверждении Правил плавания судов по внутренним водным путям") - на ВВП запрещается полное или частичное пересечение судового хода на расстоянии менее километра от приближающихся судов без согласования взаимных действий, при этом во всех случаях пересечение судового хода должно производиться под углом, близким к прямому.
2. В случае, когда невозможно движение маломерного судна за пределами судового хода, оно может двигаться по судовому ходу вдоль правой по ходу кромки в пределах десяти метров от нее, при этом оно обязано заблаговременно уходить с пути других судов без обмена звуковыми и визуальными сигналами (п. 124 Правил плавания по ВВП)
3. При этом следует учитывать, что маломерным судам запрещено останавливаться или становиться на якорь в пределах судового хода, а также у плавучих знаков навигационного оборудования (п. 95 Правил плавания по ВВП)

Нет, не может! Однако это совсем не означает, что судно, не подлежащее государственной регистрации, совсем не может пройти через шлюз!
Сделать это можно, например, в канале им. Москвы,воспользовавшись правилом, закрепленным пунктом 1.6. Порядка пропуска маломерных судов черес шлюзы ФГБУ "Канал имени Москвы", утвержденного Приказом от 10.02.2023 № 01-05-01
"К самостоятельному шлюзованию не допускаются:
- маломерные моторные суда, имеющие надувную конструкцию, за исключением жёсткокорпусных судов с надувными бортами (RIB);
- гидроциклы;
- гребные суда;
- парусные суда (без вспомогательного двигателя);
Такие суда могут быть прошлюзованы с буксирующим их судном. При этом буксируемое судно должно быть ошвартовано к борту буксирующего судна.
Судоводитель и пассажиры буксируемых судов должны находиться на буксирующем судне. Пересадка людей и швартовка буксируемого судна должны быть произведены до входа буксирующего судна в подходной канал шлюза.